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GOplot è un pacchetto R progettato specificamente per la visualizzazione di dati biologici. Il suo scopo principale è combinare e integrare dati di espressione ad alta dimensione con i risultati di un’analisi funzionale, come l’arricchimento della Gene Ontology (GO). Il pacchetto consente agli scienziati di esaminare rapidamente grandi set di dati, evidenziare tendenze e trovare modelli e correlazioni, aiutandoli a confermare o falsificare ipotesi. Fornendo grafici nuovi, originali e di alta qualità, GOplot mira a migliorare la comprensione dei dati omici e ad aiutare la comunicazione di scoperte biologicamente rilevanti.

Il pacchetto prende l’output di qualsiasi analisi di arricchimento generale e genera una varietà di grafici a diversi livelli di dettaglio, inclusi grafici a barre (utilizzando la funzione GOBar), grafici a bolle e grafici a cerchio. Ciò consente agli utenti di passare da una panoramica generale, che identifica le categorie più arricchite, a una vista più dettagliata che mostra informazioni per geni e termini specifici. Il pacchetto integra dati quantitativi come livelli di espressione (logFC), significatività dei termini (valore p aggiustato) e z-score, consentendo un’analisi più approfondita e completa dei processi biologici sottostanti.